Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ybx3Q9JKB3 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ybx3Q9JKB3 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ybx3Q9JKB3 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ybx3Q9JKB3 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ybx3Q9JKB3 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ybx3Q9JKB3 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ybx3Q9JKB3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ybx3Q9JKB3 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ybx3Q9JKB3 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ybx3Q9JKB3 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ybx3Q9JKB3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ybx3Q9JKB3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ybx3Q9JKB3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ybx3Q9JKB3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ybx3Q9JKB3 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ybx3Q9JKB3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ybx3Q9JKB3 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ybx3Q9JKB3 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ybx3Q9JKB3 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ybx3Q9JKB3 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ybx3Q9JKB3 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ybx3Q9JKB3 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ybx3Q9JKB3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ybx3Q9JKB3 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ybx3Q9JKB3 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ybx3Q9JKB3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ybx3Q9JKB3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ybx3Q9JKB3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ybx3Q9JKB3 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ybx3Q9JKB3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ybx3Q9JKB3 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ybx3Q9JKB3 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ybx3Q9JKB3 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ybx3Q9JKB3 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ybx3Q9JKB3 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ybx3Q9JKB3 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ybx3Q9JKB3 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ybx3Q9JKB3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ybx3Q9JKB3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ybx3Q9JKB3 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ybx3Q9JKB3 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ybx3Q9JKB3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ybx3Q9JKB3 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ybx3Q9JKB3 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ybx3Q9JKB3 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ybx3Q9JKB3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ybx3Q9JKB3 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ybx3Q9JKB3 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ybx3Q9JKB3 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ybx3Q9JKB3 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ybx3Q9JKB3 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ybx3Q9JKB3 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ybx3Q9JKB3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ybx3Q9JKB3 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ybx3Q9JKB3 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ybx3Q9JKB3 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ybx3Q9JKB3 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ybx3Q9JKB3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ybx3Q9JKB3 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ybx3Q9JKB3 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ybx3Q9JKB3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ybx3Q9JKB3 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ybx3Q9JKB3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ybx3Q9JKB3 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ybx3Q9JKB3 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ybx3Q9JKB3 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ybx3Q9JKB3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ybx3Q9JKB3 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ybx3Q9JKB3 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ybx3Q9JKB3 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ybx3Q9JKB3 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ybx3Q9JKB3 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ybx3Q9JKB3 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ybx3Q9JKB3 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ybx3Q9JKB3 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ybx3Q9JKB3 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ybx3Q9JKB3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ybx3Q9JKB3 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ybx3Q9JKB3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ybx3Q9JKB3 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ybx3Q9JKB3 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ybx3Q9JKB3 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ybx3Q9JKB3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ybx3Q9JKB3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ybx3Q9JKB3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ybx3Q9JKB3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ybx3Q9JKB3 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ybx3Q9JKB3 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ybx3Q9JKB3 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ybx3Q9JKB3 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ybx3Q9JKB3 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ybx3Q9JKB3 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ybx3Q9JKB3 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ybx3Q9JKB3 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ybx3Q9JKB3 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ybx3Q9JKB3 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ybx3Q9JKB3 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ybx3Q9JKB3 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ybx3Q9JKB3 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms