Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY3

Smpd3, Sphingomyelin phosphodiesterase 3, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd3Q9JJY3 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Smpd3Q9JJY3 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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