Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJW6

Alyref2, Aly/REF export factor 2, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alyref2Q9JJW6 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Alyref2Q9JJW6 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Alyref2Q9JJW6 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Alyref2Q9JJW6 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Alyref2Q9JJW6 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Alyref2Q9JJW6 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Alyref2Q9JJW6 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Alyref2Q9JJW6 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Alyref2Q9JJW6 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Alyref2Q9JJW6 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Alyref2Q9JJW6 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Alyref2Q9JJW6 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Alyref2Q9JJW6 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Alyref2Q9JJW6 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Alyref2Q9JJW6 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Alyref2Q9JJW6 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Alyref2Q9JJW6 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Alyref2Q9JJW6 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Alyref2Q9JJW6 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Alyref2Q9JJW6 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Alyref2Q9JJW6 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Alyref2Q9JJW6 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Alyref2Q9JJW6 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Alyref2Q9JJW6 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Alyref2Q9JJW6 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Alyref2Q9JJW6 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Alyref2Q9JJW6 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Alyref2Q9JJW6 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Alyref2Q9JJW6 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Alyref2Q9JJW6 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Alyref2Q9JJW6 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Alyref2Q9JJW6 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Alyref2Q9JJW6 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Alyref2Q9JJW6 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Alyref2Q9JJW6 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Alyref2Q9JJW6 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Alyref2Q9JJW6 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Alyref2Q9JJW6 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Alyref2Q9JJW6 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Alyref2Q9JJW6 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Alyref2Q9JJW6 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Alyref2Q9JJW6 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Alyref2Q9JJW6 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Alyref2Q9JJW6 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Alyref2Q9JJW6 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Alyref2Q9JJW6 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Alyref2Q9JJW6 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Alyref2Q9JJW6 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Alyref2Q9JJW6 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Alyref2Q9JJW6 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Alyref2Q9JJW6 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Alyref2Q9JJW6 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Alyref2Q9JJW6 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Alyref2Q9JJW6 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Alyref2Q9JJW6 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Alyref2Q9JJW6 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Alyref2Q9JJW6 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Alyref2Q9JJW6 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Alyref2Q9JJW6 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Alyref2Q9JJW6 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Alyref2Q9JJW6 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Alyref2Q9JJW6 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Alyref2Q9JJW6 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Alyref2Q9JJW6 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Alyref2Q9JJW6 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Alyref2Q9JJW6 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Alyref2Q9JJW6 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
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Alyref2Q9JJW6 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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Alyref2Q9JJW6 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Alyref2Q9JJW6 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Alyref2Q9JJW6 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Alyref2Q9JJW6 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Alyref2Q9JJW6 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Alyref2Q9JJW6 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Alyref2Q9JJW6 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Alyref2Q9JJW6 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Alyref2Q9JJW6 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Alyref2Q9JJW6 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Alyref2Q9JJW6 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Alyref2Q9JJW6 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Alyref2Q9JJW6 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Alyref2Q9JJW6 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Alyref2Q9JJW6 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Alyref2Q9JJW6 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Alyref2Q9JJW6 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Alyref2Q9JJW6 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Alyref2Q9JJW6 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Alyref2Q9JJW6 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Alyref2Q9JJW6 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Alyref2Q9JJW6 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Alyref2Q9JJW6 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Alyref2Q9JJW6 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Alyref2Q9JJW6 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Alyref2Q9JJW6 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Alyref2Q9JJW6 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Alyref2Q9JJW6 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Alyref2Q9JJW6 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Alyref2Q9JJW6 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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