Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms