Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS0

Scube2, Signal peptide, CUB and EGF-like domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scube2Q9JJS0 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Scube2Q9JJS0 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Scube2Q9JJS0 Gm18515-201ENSMUST00000219755 797 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Scube2Q9JJS0 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scube2Q9JJS0 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scube2Q9JJS0 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scube2Q9JJS0 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms