Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF6

Efcc1, EF-hand and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcc1Q9JJF6 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms