Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms