Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHE7

Tssc4, Protein TSSC4, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tssc4Q9JHE7 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tssc4Q9JHE7 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tssc4Q9JHE7 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tssc4Q9JHE7 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tssc4Q9JHE7 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tssc4Q9JHE7 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tssc4Q9JHE7 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tssc4Q9JHE7 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tssc4Q9JHE7 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tssc4Q9JHE7 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tssc4Q9JHE7 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tssc4Q9JHE7 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tssc4Q9JHE7 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tssc4Q9JHE7 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tssc4Q9JHE7 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tssc4Q9JHE7 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tssc4Q9JHE7 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tssc4Q9JHE7 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tssc4Q9JHE7 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tssc4Q9JHE7 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tssc4Q9JHE7 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tssc4Q9JHE7 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tssc4Q9JHE7 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tssc4Q9JHE7 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tssc4Q9JHE7 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tssc4Q9JHE7 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tssc4Q9JHE7 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tssc4Q9JHE7 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tssc4Q9JHE7 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tssc4Q9JHE7 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tssc4Q9JHE7 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tssc4Q9JHE7 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tssc4Q9JHE7 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tssc4Q9JHE7 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tssc4Q9JHE7 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tssc4Q9JHE7 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tssc4Q9JHE7 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms