Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESX2

Sp6, Transcription factor Sp6, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp6Q9ESX2 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sp6Q9ESX2 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sp6Q9ESX2 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sp6Q9ESX2 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sp6Q9ESX2 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sp6Q9ESX2 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sp6Q9ESX2 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sp6Q9ESX2 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sp6Q9ESX2 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sp6Q9ESX2 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sp6Q9ESX2 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sp6Q9ESX2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sp6Q9ESX2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sp6Q9ESX2 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sp6Q9ESX2 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sp6Q9ESX2 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sp6Q9ESX2 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sp6Q9ESX2 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sp6Q9ESX2 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sp6Q9ESX2 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sp6Q9ESX2 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sp6Q9ESX2 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sp6Q9ESX2 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sp6Q9ESX2 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sp6Q9ESX2 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sp6Q9ESX2 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sp6Q9ESX2 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sp6Q9ESX2 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sp6Q9ESX2 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sp6Q9ESX2 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sp6Q9ESX2 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sp6Q9ESX2 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sp6Q9ESX2 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sp6Q9ESX2 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sp6Q9ESX2 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sp6Q9ESX2 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sp6Q9ESX2 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sp6Q9ESX2 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sp6Q9ESX2 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sp6Q9ESX2 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sp6Q9ESX2 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sp6Q9ESX2 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sp6Q9ESX2 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sp6Q9ESX2 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sp6Q9ESX2 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sp6Q9ESX2 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sp6Q9ESX2 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sp6Q9ESX2 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sp6Q9ESX2 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sp6Q9ESX2 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sp6Q9ESX2 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sp6Q9ESX2 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sp6Q9ESX2 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sp6Q9ESX2 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sp6Q9ESX2 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sp6Q9ESX2 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sp6Q9ESX2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sp6Q9ESX2 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sp6Q9ESX2 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sp6Q9ESX2 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sp6Q9ESX2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sp6Q9ESX2 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sp6Q9ESX2 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sp6Q9ESX2 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sp6Q9ESX2 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sp6Q9ESX2 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sp6Q9ESX2 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sp6Q9ESX2 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sp6Q9ESX2 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sp6Q9ESX2 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sp6Q9ESX2 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Sp6Q9ESX2 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sp6Q9ESX2 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sp6Q9ESX2 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sp6Q9ESX2 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sp6Q9ESX2 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sp6Q9ESX2 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sp6Q9ESX2 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sp6Q9ESX2 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sp6Q9ESX2 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sp6Q9ESX2 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sp6Q9ESX2 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sp6Q9ESX2 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sp6Q9ESX2 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Sp6Q9ESX2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sp6Q9ESX2 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sp6Q9ESX2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sp6Q9ESX2 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sp6Q9ESX2 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sp6Q9ESX2 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sp6Q9ESX2 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sp6Q9ESX2 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sp6Q9ESX2 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sp6Q9ESX2 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sp6Q9ESX2 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sp6Q9ESX2 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sp6Q9ESX2 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sp6Q9ESX2 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sp6Q9ESX2 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms