Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESW8

Pgpep1, Pyroglutamyl-peptidase 1, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgpep1Q9ESW8 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pgpep1Q9ESW8 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pgpep1Q9ESW8 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pgpep1Q9ESW8 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pgpep1Q9ESW8 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pgpep1Q9ESW8 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pgpep1Q9ESW8 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pgpep1Q9ESW8 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pgpep1Q9ESW8 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pgpep1Q9ESW8 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pgpep1Q9ESW8 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pgpep1Q9ESW8 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pgpep1Q9ESW8 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pgpep1Q9ESW8 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pgpep1Q9ESW8 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pgpep1Q9ESW8 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pgpep1Q9ESW8 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pgpep1Q9ESW8 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pgpep1Q9ESW8 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pgpep1Q9ESW8 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pgpep1Q9ESW8 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pgpep1Q9ESW8 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pgpep1Q9ESW8 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Pgpep1Q9ESW8 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pgpep1Q9ESW8 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pgpep1Q9ESW8 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Pgpep1Q9ESW8 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pgpep1Q9ESW8 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pgpep1Q9ESW8 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pgpep1Q9ESW8 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pgpep1Q9ESW8 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pgpep1Q9ESW8 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pgpep1Q9ESW8 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pgpep1Q9ESW8 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pgpep1Q9ESW8 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pgpep1Q9ESW8 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pgpep1Q9ESW8 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pgpep1Q9ESW8 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pgpep1Q9ESW8 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pgpep1Q9ESW8 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pgpep1Q9ESW8 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pgpep1Q9ESW8 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pgpep1Q9ESW8 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pgpep1Q9ESW8 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pgpep1Q9ESW8 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pgpep1Q9ESW8 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pgpep1Q9ESW8 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pgpep1Q9ESW8 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pgpep1Q9ESW8 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pgpep1Q9ESW8 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pgpep1Q9ESW8 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pgpep1Q9ESW8 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pgpep1Q9ESW8 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pgpep1Q9ESW8 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pgpep1Q9ESW8 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pgpep1Q9ESW8 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pgpep1Q9ESW8 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pgpep1Q9ESW8 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pgpep1Q9ESW8 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pgpep1Q9ESW8 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pgpep1Q9ESW8 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pgpep1Q9ESW8 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pgpep1Q9ESW8 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Pgpep1Q9ESW8 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pgpep1Q9ESW8 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pgpep1Q9ESW8 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pgpep1Q9ESW8 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pgpep1Q9ESW8 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pgpep1Q9ESW8 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pgpep1Q9ESW8 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pgpep1Q9ESW8 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pgpep1Q9ESW8 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pgpep1Q9ESW8 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Pgpep1Q9ESW8 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Pgpep1Q9ESW8 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Pgpep1Q9ESW8 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Pgpep1Q9ESW8 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Pgpep1Q9ESW8 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Pgpep1Q9ESW8 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Pgpep1Q9ESW8 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Pgpep1Q9ESW8 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Pgpep1Q9ESW8 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pgpep1Q9ESW8 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pgpep1Q9ESW8 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pgpep1Q9ESW8 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pgpep1Q9ESW8 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pgpep1Q9ESW8 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pgpep1Q9ESW8 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pgpep1Q9ESW8 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pgpep1Q9ESW8 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pgpep1Q9ESW8 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pgpep1Q9ESW8 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pgpep1Q9ESW8 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pgpep1Q9ESW8 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pgpep1Q9ESW8 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pgpep1Q9ESW8 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pgpep1Q9ESW8 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pgpep1Q9ESW8 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pgpep1Q9ESW8 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pgpep1Q9ESW8 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms