Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESD6

Cmtm7, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm7Q9ESD6 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cmtm7Q9ESD6 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cmtm7Q9ESD6 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cmtm7Q9ESD6 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cmtm7Q9ESD6 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cmtm7Q9ESD6 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cmtm7Q9ESD6 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cmtm7Q9ESD6 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cmtm7Q9ESD6 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cmtm7Q9ESD6 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cmtm7Q9ESD6 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cmtm7Q9ESD6 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cmtm7Q9ESD6 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cmtm7Q9ESD6 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cmtm7Q9ESD6 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cmtm7Q9ESD6 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cmtm7Q9ESD6 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cmtm7Q9ESD6 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cmtm7Q9ESD6 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cmtm7Q9ESD6 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cmtm7Q9ESD6 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cmtm7Q9ESD6 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cmtm7Q9ESD6 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cmtm7Q9ESD6 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cmtm7Q9ESD6 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cmtm7Q9ESD6 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cmtm7Q9ESD6 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cmtm7Q9ESD6 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmtm7Q9ESD6 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmtm7Q9ESD6 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmtm7Q9ESD6 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmtm7Q9ESD6 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmtm7Q9ESD6 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmtm7Q9ESD6 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmtm7Q9ESD6 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmtm7Q9ESD6 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmtm7Q9ESD6 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmtm7Q9ESD6 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmtm7Q9ESD6 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmtm7Q9ESD6 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmtm7Q9ESD6 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmtm7Q9ESD6 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmtm7Q9ESD6 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmtm7Q9ESD6 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmtm7Q9ESD6 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmtm7Q9ESD6 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmtm7Q9ESD6 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmtm7Q9ESD6 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmtm7Q9ESD6 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmtm7Q9ESD6 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmtm7Q9ESD6 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmtm7Q9ESD6 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmtm7Q9ESD6 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmtm7Q9ESD6 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmtm7Q9ESD6 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmtm7Q9ESD6 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cmtm7Q9ESD6 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cmtm7Q9ESD6 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cmtm7Q9ESD6 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cmtm7Q9ESD6 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cmtm7Q9ESD6 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cmtm7Q9ESD6 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cmtm7Q9ESD6 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cmtm7Q9ESD6 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cmtm7Q9ESD6 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cmtm7Q9ESD6 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cmtm7Q9ESD6 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms