Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH8

Slc28a3, Solute carrier family 28 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a3Q9ERH8 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc28a3Q9ERH8 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc28a3Q9ERH8 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc28a3Q9ERH8 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc28a3Q9ERH8 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc28a3Q9ERH8 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc28a3Q9ERH8 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc28a3Q9ERH8 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc28a3Q9ERH8 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc28a3Q9ERH8 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc28a3Q9ERH8 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc28a3Q9ERH8 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc28a3Q9ERH8 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc28a3Q9ERH8 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc28a3Q9ERH8 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc28a3Q9ERH8 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc28a3Q9ERH8 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc28a3Q9ERH8 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc28a3Q9ERH8 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc28a3Q9ERH8 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc28a3Q9ERH8 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc28a3Q9ERH8 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc28a3Q9ERH8 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc28a3Q9ERH8 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc28a3Q9ERH8 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc28a3Q9ERH8 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc28a3Q9ERH8 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc28a3Q9ERH8 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc28a3Q9ERH8 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc28a3Q9ERH8 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc28a3Q9ERH8 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms