Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB5

Slco1c1, Solute carrier organic anion transporter family member 1C1, mousemouse

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slco1c1Q9ERB5 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Slco1c1Q9ERB5 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slco1c1Q9ERB5 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Slco1c1Q9ERB5 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slco1c1Q9ERB5 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Slco1c1Q9ERB5 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Slco1c1Q9ERB5 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slco1c1Q9ERB5 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slco1c1Q9ERB5 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slco1c1Q9ERB5 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slco1c1Q9ERB5 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slco1c1Q9ERB5 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slco1c1Q9ERB5 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slco1c1Q9ERB5 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slco1c1Q9ERB5 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slco1c1Q9ERB5 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slco1c1Q9ERB5 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slco1c1Q9ERB5 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slco1c1Q9ERB5 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slco1c1Q9ERB5 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Slco1c1Q9ERB5 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slco1c1Q9ERB5 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Slco1c1Q9ERB5 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Slco1c1Q9ERB5 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slco1c1Q9ERB5 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slco1c1Q9ERB5 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slco1c1Q9ERB5 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Slco1c1Q9ERB5 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Slco1c1Q9ERB5 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slco1c1Q9ERB5 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slco1c1Q9ERB5 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slco1c1Q9ERB5 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slco1c1Q9ERB5 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slco1c1Q9ERB5 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Slco1c1Q9ERB5 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Slco1c1Q9ERB5 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Slco1c1Q9ERB5 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slco1c1Q9ERB5 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slco1c1Q9ERB5 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slco1c1Q9ERB5 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Slco1c1Q9ERB5 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slco1c1Q9ERB5 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slco1c1Q9ERB5 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slco1c1Q9ERB5 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slco1c1Q9ERB5 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slco1c1Q9ERB5 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Slco1c1Q9ERB5 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slco1c1Q9ERB5 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Slco1c1Q9ERB5 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slco1c1Q9ERB5 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slco1c1Q9ERB5 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.04■□□□□ -0
Slco1c1Q9ERB5 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slco1c1Q9ERB5 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slco1c1Q9ERB5 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slco1c1Q9ERB5 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Slco1c1Q9ERB5 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slco1c1Q9ERB5 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Slco1c1Q9ERB5 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Slco1c1Q9ERB5 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slco1c1Q9ERB5 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slco1c1Q9ERB5 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Slco1c1Q9ERB5 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slco1c1Q9ERB5 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slco1c1Q9ERB5 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Slco1c1Q9ERB5 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slco1c1Q9ERB5 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Slco1c1Q9ERB5 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slco1c1Q9ERB5 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slco1c1Q9ERB5 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slco1c1Q9ERB5 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slco1c1Q9ERB5 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Slco1c1Q9ERB5 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slco1c1Q9ERB5 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slco1c1Q9ERB5 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slco1c1Q9ERB5 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Slco1c1Q9ERB5 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slco1c1Q9ERB5 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slco1c1Q9ERB5 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slco1c1Q9ERB5 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slco1c1Q9ERB5 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slco1c1Q9ERB5 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slco1c1Q9ERB5 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slco1c1Q9ERB5 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Slco1c1Q9ERB5 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Slco1c1Q9ERB5 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slco1c1Q9ERB5 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slco1c1Q9ERB5 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slco1c1Q9ERB5 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slco1c1Q9ERB5 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slco1c1Q9ERB5 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Slco1c1Q9ERB5 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slco1c1Q9ERB5 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Slco1c1Q9ERB5 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slco1c1Q9ERB5 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slco1c1Q9ERB5 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slco1c1Q9ERB5 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Slco1c1Q9ERB5 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Slco1c1Q9ERB5 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Slco1c1Q9ERB5 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slco1c1Q9ERB5 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms