Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA6

Tfip11, Tuftelin-interacting protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfip11Q9ERA6 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tfip11Q9ERA6 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tfip11Q9ERA6 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Tfip11Q9ERA6 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tfip11Q9ERA6 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Tfip11Q9ERA6 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tfip11Q9ERA6 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tfip11Q9ERA6 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tfip11Q9ERA6 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tfip11Q9ERA6 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tfip11Q9ERA6 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tfip11Q9ERA6 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tfip11Q9ERA6 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tfip11Q9ERA6 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tfip11Q9ERA6 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tfip11Q9ERA6 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tfip11Q9ERA6 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tfip11Q9ERA6 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tfip11Q9ERA6 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tfip11Q9ERA6 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tfip11Q9ERA6 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tfip11Q9ERA6 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tfip11Q9ERA6 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tfip11Q9ERA6 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tfip11Q9ERA6 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tfip11Q9ERA6 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tfip11Q9ERA6 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tfip11Q9ERA6 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tfip11Q9ERA6 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tfip11Q9ERA6 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tfip11Q9ERA6 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tfip11Q9ERA6 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tfip11Q9ERA6 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tfip11Q9ERA6 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tfip11Q9ERA6 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tfip11Q9ERA6 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tfip11Q9ERA6 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tfip11Q9ERA6 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tfip11Q9ERA6 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tfip11Q9ERA6 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tfip11Q9ERA6 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tfip11Q9ERA6 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tfip11Q9ERA6 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tfip11Q9ERA6 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tfip11Q9ERA6 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tfip11Q9ERA6 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Tfip11Q9ERA6 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tfip11Q9ERA6 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tfip11Q9ERA6 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tfip11Q9ERA6 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tfip11Q9ERA6 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tfip11Q9ERA6 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tfip11Q9ERA6 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tfip11Q9ERA6 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tfip11Q9ERA6 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tfip11Q9ERA6 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tfip11Q9ERA6 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tfip11Q9ERA6 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tfip11Q9ERA6 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tfip11Q9ERA6 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tfip11Q9ERA6 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Tfip11Q9ERA6 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tfip11Q9ERA6 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tfip11Q9ERA6 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tfip11Q9ERA6 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tfip11Q9ERA6 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Tfip11Q9ERA6 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tfip11Q9ERA6 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tfip11Q9ERA6 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tfip11Q9ERA6 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tfip11Q9ERA6 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tfip11Q9ERA6 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tfip11Q9ERA6 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tfip11Q9ERA6 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tfip11Q9ERA6 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tfip11Q9ERA6 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tfip11Q9ERA6 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tfip11Q9ERA6 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tfip11Q9ERA6 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tfip11Q9ERA6 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tfip11Q9ERA6 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tfip11Q9ERA6 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tfip11Q9ERA6 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tfip11Q9ERA6 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tfip11Q9ERA6 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tfip11Q9ERA6 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tfip11Q9ERA6 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tfip11Q9ERA6 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tfip11Q9ERA6 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tfip11Q9ERA6 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tfip11Q9ERA6 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tfip11Q9ERA6 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tfip11Q9ERA6 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tfip11Q9ERA6 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Tfip11Q9ERA6 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Tfip11Q9ERA6 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tfip11Q9ERA6 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tfip11Q9ERA6 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tfip11Q9ERA6 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tfip11Q9ERA6 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms