Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms