Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPK8

Trpv4, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 4, mousemouse

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv4Q9EPK8 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpv4Q9EPK8 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpv4Q9EPK8 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpv4Q9EPK8 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpv4Q9EPK8 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpv4Q9EPK8 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpv4Q9EPK8 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpv4Q9EPK8 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpv4Q9EPK8 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpv4Q9EPK8 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpv4Q9EPK8 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpv4Q9EPK8 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpv4Q9EPK8 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpv4Q9EPK8 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpv4Q9EPK8 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpv4Q9EPK8 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpv4Q9EPK8 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpv4Q9EPK8 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpv4Q9EPK8 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpv4Q9EPK8 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpv4Q9EPK8 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpv4Q9EPK8 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms