Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms