Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms