Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T0

Fam3a, Protein FAM3A, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam3aQ9D8T0 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam3aQ9D8T0 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam3aQ9D8T0 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam3aQ9D8T0 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam3aQ9D8T0 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fam3aQ9D8T0 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fam3aQ9D8T0 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fam3aQ9D8T0 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fam3aQ9D8T0 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam3aQ9D8T0 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam3aQ9D8T0 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam3aQ9D8T0 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam3aQ9D8T0 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam3aQ9D8T0 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam3aQ9D8T0 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam3aQ9D8T0 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam3aQ9D8T0 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam3aQ9D8T0 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam3aQ9D8T0 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam3aQ9D8T0 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam3aQ9D8T0 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam3aQ9D8T0 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam3aQ9D8T0 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam3aQ9D8T0 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam3aQ9D8T0 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam3aQ9D8T0 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam3aQ9D8T0 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam3aQ9D8T0 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam3aQ9D8T0 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam3aQ9D8T0 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam3aQ9D8T0 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam3aQ9D8T0 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam3aQ9D8T0 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam3aQ9D8T0 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam3aQ9D8T0 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam3aQ9D8T0 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam3aQ9D8T0 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam3aQ9D8T0 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam3aQ9D8T0 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam3aQ9D8T0 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam3aQ9D8T0 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam3aQ9D8T0 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam3aQ9D8T0 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam3aQ9D8T0 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam3aQ9D8T0 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam3aQ9D8T0 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam3aQ9D8T0 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam3aQ9D8T0 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam3aQ9D8T0 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam3aQ9D8T0 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam3aQ9D8T0 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam3aQ9D8T0 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam3aQ9D8T0 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam3aQ9D8T0 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam3aQ9D8T0 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam3aQ9D8T0 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam3aQ9D8T0 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam3aQ9D8T0 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam3aQ9D8T0 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam3aQ9D8T0 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam3aQ9D8T0 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam3aQ9D8T0 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam3aQ9D8T0 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam3aQ9D8T0 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam3aQ9D8T0 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam3aQ9D8T0 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam3aQ9D8T0 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam3aQ9D8T0 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam3aQ9D8T0 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam3aQ9D8T0 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam3aQ9D8T0 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam3aQ9D8T0 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam3aQ9D8T0 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam3aQ9D8T0 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam3aQ9D8T0 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam3aQ9D8T0 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam3aQ9D8T0 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam3aQ9D8T0 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam3aQ9D8T0 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam3aQ9D8T0 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam3aQ9D8T0 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam3aQ9D8T0 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam3aQ9D8T0 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam3aQ9D8T0 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam3aQ9D8T0 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam3aQ9D8T0 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam3aQ9D8T0 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam3aQ9D8T0 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam3aQ9D8T0 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam3aQ9D8T0 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam3aQ9D8T0 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam3aQ9D8T0 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam3aQ9D8T0 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam3aQ9D8T0 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam3aQ9D8T0 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam3aQ9D8T0 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam3aQ9D8T0 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam3aQ9D8T0 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam3aQ9D8T0 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam3aQ9D8T0 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms