Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Gtf3c6Q9D8P7 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Gtf3c6Q9D8P7 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Gtf3c6Q9D8P7 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Gtf3c6Q9D8P7 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf3c6Q9D8P7 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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