Protein–RNA interactions for Protein: Q9D816

Cyp2c55, Cytochrome P450 2C55, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2c55Q9D816 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyp2c55Q9D816 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyp2c55Q9D816 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyp2c55Q9D816 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyp2c55Q9D816 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyp2c55Q9D816 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyp2c55Q9D816 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyp2c55Q9D816 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyp2c55Q9D816 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyp2c55Q9D816 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyp2c55Q9D816 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyp2c55Q9D816 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyp2c55Q9D816 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyp2c55Q9D816 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyp2c55Q9D816 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyp2c55Q9D816 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyp2c55Q9D816 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyp2c55Q9D816 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyp2c55Q9D816 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyp2c55Q9D816 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyp2c55Q9D816 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyp2c55Q9D816 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyp2c55Q9D816 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyp2c55Q9D816 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyp2c55Q9D816 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyp2c55Q9D816 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyp2c55Q9D816 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyp2c55Q9D816 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyp2c55Q9D816 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyp2c55Q9D816 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyp2c55Q9D816 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyp2c55Q9D816 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyp2c55Q9D816 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyp2c55Q9D816 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyp2c55Q9D816 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyp2c55Q9D816 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyp2c55Q9D816 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyp2c55Q9D816 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyp2c55Q9D816 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyp2c55Q9D816 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp2c55Q9D816 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp2c55Q9D816 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp2c55Q9D816 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp2c55Q9D816 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp2c55Q9D816 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp2c55Q9D816 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp2c55Q9D816 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp2c55Q9D816 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp2c55Q9D816 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp2c55Q9D816 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp2c55Q9D816 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp2c55Q9D816 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp2c55Q9D816 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp2c55Q9D816 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp2c55Q9D816 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp2c55Q9D816 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp2c55Q9D816 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp2c55Q9D816 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp2c55Q9D816 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp2c55Q9D816 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp2c55Q9D816 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp2c55Q9D816 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp2c55Q9D816 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp2c55Q9D816 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp2c55Q9D816 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp2c55Q9D816 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp2c55Q9D816 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp2c55Q9D816 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp2c55Q9D816 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp2c55Q9D816 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp2c55Q9D816 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp2c55Q9D816 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp2c55Q9D816 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp2c55Q9D816 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp2c55Q9D816 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp2c55Q9D816 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp2c55Q9D816 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp2c55Q9D816 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp2c55Q9D816 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp2c55Q9D816 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp2c55Q9D816 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp2c55Q9D816 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp2c55Q9D816 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp2c55Q9D816 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp2c55Q9D816 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp2c55Q9D816 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp2c55Q9D816 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp2c55Q9D816 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp2c55Q9D816 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp2c55Q9D816 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp2c55Q9D816 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp2c55Q9D816 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp2c55Q9D816 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp2c55Q9D816 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp2c55Q9D816 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp2c55Q9D816 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp2c55Q9D816 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp2c55Q9D816 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp2c55Q9D816 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp2c55Q9D816 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms