Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7Y9

Slx4ip, Protein SLX4IP, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4ipQ9D7Y9 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slx4ipQ9D7Y9 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slx4ipQ9D7Y9 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slx4ipQ9D7Y9 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slx4ipQ9D7Y9 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slx4ipQ9D7Y9 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slx4ipQ9D7Y9 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slx4ipQ9D7Y9 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slx4ipQ9D7Y9 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slx4ipQ9D7Y9 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slx4ipQ9D7Y9 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slx4ipQ9D7Y9 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Slx4ipQ9D7Y9 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Slx4ipQ9D7Y9 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slx4ipQ9D7Y9 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slx4ipQ9D7Y9 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slx4ipQ9D7Y9 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slx4ipQ9D7Y9 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slx4ipQ9D7Y9 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slx4ipQ9D7Y9 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slx4ipQ9D7Y9 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slx4ipQ9D7Y9 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slx4ipQ9D7Y9 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slx4ipQ9D7Y9 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slx4ipQ9D7Y9 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slx4ipQ9D7Y9 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slx4ipQ9D7Y9 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slx4ipQ9D7Y9 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slx4ipQ9D7Y9 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slx4ipQ9D7Y9 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slx4ipQ9D7Y9 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slx4ipQ9D7Y9 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slx4ipQ9D7Y9 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slx4ipQ9D7Y9 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slx4ipQ9D7Y9 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slx4ipQ9D7Y9 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slx4ipQ9D7Y9 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slx4ipQ9D7Y9 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slx4ipQ9D7Y9 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slx4ipQ9D7Y9 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slx4ipQ9D7Y9 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slx4ipQ9D7Y9 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slx4ipQ9D7Y9 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slx4ipQ9D7Y9 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slx4ipQ9D7Y9 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slx4ipQ9D7Y9 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slx4ipQ9D7Y9 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms