Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7E4

UPF0449 protein C19orf25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D7E4 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q9D7E4 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q9D7E4 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Q9D7E4 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q9D7E4 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q9D7E4 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q9D7E4 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q9D7E4 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q9D7E4 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q9D7E4 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q9D7E4 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q9D7E4 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q9D7E4 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q9D7E4 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q9D7E4 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms