Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms