Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

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Length 645 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Rab11fip1Q9D620 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
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