Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms