Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q8

Uncharacterized protein C1orf141 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D5Q8 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9D5Q8 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9D5Q8 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9D5Q8 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9D5Q8 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9D5Q8 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9D5Q8 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9D5Q8 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9D5Q8 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9D5Q8 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9D5Q8 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9D5Q8 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9D5Q8 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9D5Q8 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9D5Q8 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9D5Q8 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9D5Q8 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9D5Q8 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9D5Q8 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9D5Q8 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9D5Q8 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9D5Q8 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9D5Q8 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9D5Q8 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9D5Q8 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9D5Q8 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9D5Q8 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9D5Q8 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9D5Q8 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9D5Q8 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9D5Q8 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D5Q8 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D5Q8 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D5Q8 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D5Q8 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D5Q8 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D5Q8 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D5Q8 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D5Q8 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D5Q8 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D5Q8 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D5Q8 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D5Q8 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D5Q8 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D5Q8 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D5Q8 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D5Q8 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D5Q8 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D5Q8 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D5Q8 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D5Q8 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D5Q8 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D5Q8 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D5Q8 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D5Q8 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D5Q8 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D5Q8 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D5Q8 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D5Q8 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D5Q8 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D5Q8 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D5Q8 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D5Q8 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D5Q8 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D5Q8 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D5Q8 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D5Q8 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D5Q8 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D5Q8 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D5Q8 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D5Q8 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D5Q8 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D5Q8 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D5Q8 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D5Q8 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D5Q8 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D5Q8 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D5Q8 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D5Q8 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D5Q8 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D5Q8 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D5Q8 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D5Q8 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D5Q8 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D5Q8 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D5Q8 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D5Q8 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D5Q8 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D5Q8 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D5Q8 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D5Q8 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D5Q8 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D5Q8 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D5Q8 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D5Q8 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D5Q8 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D5Q8 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D5Q8 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D5Q8 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9D5Q8 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms