Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms