Protein–RNA interactions for Protein: Q9D506

Gm3404, Predicted gene 3404, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3404Q9D506 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3404Q9D506 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3404Q9D506 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3404Q9D506 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3404Q9D506 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3404Q9D506 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3404Q9D506 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3404Q9D506 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3404Q9D506 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3404Q9D506 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3404Q9D506 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3404Q9D506 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3404Q9D506 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3404Q9D506 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3404Q9D506 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3404Q9D506 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3404Q9D506 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3404Q9D506 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3404Q9D506 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3404Q9D506 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3404Q9D506 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3404Q9D506 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3404Q9D506 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3404Q9D506 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3404Q9D506 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3404Q9D506 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3404Q9D506 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3404Q9D506 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3404Q9D506 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3404Q9D506 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3404Q9D506 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3404Q9D506 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3404Q9D506 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3404Q9D506 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3404Q9D506 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3404Q9D506 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3404Q9D506 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3404Q9D506 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3404Q9D506 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3404Q9D506 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3404Q9D506 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3404Q9D506 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3404Q9D506 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3404Q9D506 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3404Q9D506 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3404Q9D506 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3404Q9D506 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3404Q9D506 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3404Q9D506 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3404Q9D506 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3404Q9D506 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3404Q9D506 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3404Q9D506 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3404Q9D506 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3404Q9D506 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3404Q9D506 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3404Q9D506 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3404Q9D506 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3404Q9D506 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3404Q9D506 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3404Q9D506 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3404Q9D506 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3404Q9D506 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3404Q9D506 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3404Q9D506 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3404Q9D506 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3404Q9D506 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3404Q9D506 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3404Q9D506 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3404Q9D506 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3404Q9D506 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3404Q9D506 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3404Q9D506 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3404Q9D506 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3404Q9D506 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3404Q9D506 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3404Q9D506 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3404Q9D506 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3404Q9D506 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3404Q9D506 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3404Q9D506 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3404Q9D506 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3404Q9D506 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3404Q9D506 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3404Q9D506 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3404Q9D506 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3404Q9D506 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3404Q9D506 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3404Q9D506 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3404Q9D506 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3404Q9D506 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3404Q9D506 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3404Q9D506 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3404Q9D506 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3404Q9D506 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3404Q9D506 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3404Q9D506 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3404Q9D506 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm3404Q9D506 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm3404Q9D506 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms