Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms