Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H2

Gcc1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc1Q9D4H2 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gcc1Q9D4H2 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gcc1Q9D4H2 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gcc1Q9D4H2 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gcc1Q9D4H2 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gcc1Q9D4H2 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gcc1Q9D4H2 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gcc1Q9D4H2 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gcc1Q9D4H2 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gcc1Q9D4H2 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gcc1Q9D4H2 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gcc1Q9D4H2 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gcc1Q9D4H2 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gcc1Q9D4H2 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gcc1Q9D4H2 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gcc1Q9D4H2 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gcc1Q9D4H2 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Gcc1Q9D4H2 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gcc1Q9D4H2 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gcc1Q9D4H2 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gcc1Q9D4H2 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gcc1Q9D4H2 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gcc1Q9D4H2 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gcc1Q9D4H2 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gcc1Q9D4H2 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Gcc1Q9D4H2 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gcc1Q9D4H2 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gcc1Q9D4H2 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gcc1Q9D4H2 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gcc1Q9D4H2 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gcc1Q9D4H2 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gcc1Q9D4H2 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gcc1Q9D4H2 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gcc1Q9D4H2 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Gcc1Q9D4H2 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gcc1Q9D4H2 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gcc1Q9D4H2 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Gcc1Q9D4H2 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gcc1Q9D4H2 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gcc1Q9D4H2 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gcc1Q9D4H2 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Gcc1Q9D4H2 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gcc1Q9D4H2 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gcc1Q9D4H2 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gcc1Q9D4H2 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gcc1Q9D4H2 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gcc1Q9D4H2 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gcc1Q9D4H2 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gcc1Q9D4H2 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gcc1Q9D4H2 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gcc1Q9D4H2 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gcc1Q9D4H2 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gcc1Q9D4H2 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gcc1Q9D4H2 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gcc1Q9D4H2 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gcc1Q9D4H2 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gcc1Q9D4H2 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gcc1Q9D4H2 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gcc1Q9D4H2 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gcc1Q9D4H2 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gcc1Q9D4H2 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gcc1Q9D4H2 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gcc1Q9D4H2 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gcc1Q9D4H2 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gcc1Q9D4H2 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gcc1Q9D4H2 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Gcc1Q9D4H2 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gcc1Q9D4H2 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gcc1Q9D4H2 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gcc1Q9D4H2 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gcc1Q9D4H2 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gcc1Q9D4H2 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gcc1Q9D4H2 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gcc1Q9D4H2 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gcc1Q9D4H2 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gcc1Q9D4H2 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gcc1Q9D4H2 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gcc1Q9D4H2 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gcc1Q9D4H2 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gcc1Q9D4H2 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gcc1Q9D4H2 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gcc1Q9D4H2 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gcc1Q9D4H2 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gcc1Q9D4H2 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gcc1Q9D4H2 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Gcc1Q9D4H2 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gcc1Q9D4H2 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gcc1Q9D4H2 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gcc1Q9D4H2 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gcc1Q9D4H2 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gcc1Q9D4H2 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gcc1Q9D4H2 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gcc1Q9D4H2 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gcc1Q9D4H2 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gcc1Q9D4H2 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gcc1Q9D4H2 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gcc1Q9D4H2 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gcc1Q9D4H2 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gcc1Q9D4H2 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gcc1Q9D4H2 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms