Protein–RNA interactions for Protein: Q9D498

Iqcf3, IQ domain-containing protein F3, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Iqcf3Q9D498 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Iqcf3Q9D498 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Iqcf3Q9D498 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Iqcf3Q9D498 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Iqcf3Q9D498 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Iqcf3Q9D498 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Iqcf3Q9D498 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Iqcf3Q9D498 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Iqcf3Q9D498 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Iqcf3Q9D498 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Iqcf3Q9D498 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Iqcf3Q9D498 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Iqcf3Q9D498 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Iqcf3Q9D498 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Iqcf3Q9D498 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Iqcf3Q9D498 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Iqcf3Q9D498 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Iqcf3Q9D498 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Iqcf3Q9D498 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Iqcf3Q9D498 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Iqcf3Q9D498 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Iqcf3Q9D498 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Iqcf3Q9D498 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Iqcf3Q9D498 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Iqcf3Q9D498 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Iqcf3Q9D498 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Iqcf3Q9D498 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Iqcf3Q9D498 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Iqcf3Q9D498 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Iqcf3Q9D498 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Iqcf3Q9D498 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Iqcf3Q9D498 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Iqcf3Q9D498 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Iqcf3Q9D498 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Iqcf3Q9D498 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Iqcf3Q9D498 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Iqcf3Q9D498 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Iqcf3Q9D498 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Iqcf3Q9D498 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Iqcf3Q9D498 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Iqcf3Q9D498 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Iqcf3Q9D498 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Iqcf3Q9D498 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Iqcf3Q9D498 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Iqcf3Q9D498 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Iqcf3Q9D498 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Iqcf3Q9D498 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Iqcf3Q9D498 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Iqcf3Q9D498 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Iqcf3Q9D498 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Iqcf3Q9D498 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Iqcf3Q9D498 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Iqcf3Q9D498 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Iqcf3Q9D498 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Iqcf3Q9D498 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Iqcf3Q9D498 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Iqcf3Q9D498 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Iqcf3Q9D498 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Iqcf3Q9D498 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Iqcf3Q9D498 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Iqcf3Q9D498 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Iqcf3Q9D498 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Iqcf3Q9D498 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Iqcf3Q9D498 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Iqcf3Q9D498 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Iqcf3Q9D498 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Iqcf3Q9D498 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Iqcf3Q9D498 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Iqcf3Q9D498 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Iqcf3Q9D498 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Iqcf3Q9D498 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Iqcf3Q9D498 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Iqcf3Q9D498 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Iqcf3Q9D498 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Iqcf3Q9D498 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Iqcf3Q9D498 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Iqcf3Q9D498 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Iqcf3Q9D498 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Iqcf3Q9D498 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Iqcf3Q9D498 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Iqcf3Q9D498 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Iqcf3Q9D498 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Iqcf3Q9D498 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Iqcf3Q9D498 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Iqcf3Q9D498 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Iqcf3Q9D498 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Iqcf3Q9D498 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Iqcf3Q9D498 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Iqcf3Q9D498 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Iqcf3Q9D498 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Iqcf3Q9D498 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Iqcf3Q9D498 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Iqcf3Q9D498 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Iqcf3Q9D498 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Iqcf3Q9D498 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Iqcf3Q9D498 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Iqcf3Q9D498 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Iqcf3Q9D498 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Iqcf3Q9D498 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Iqcf3Q9D498 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms