Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3R6

Katnal2, Katanin p60 ATPase-containing subunit A-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Katnal2Q9D3R6 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Katnal2Q9D3R6 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Katnal2Q9D3R6 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Katnal2Q9D3R6 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Katnal2Q9D3R6 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Katnal2Q9D3R6 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Katnal2Q9D3R6 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Katnal2Q9D3R6 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Katnal2Q9D3R6 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Katnal2Q9D3R6 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Katnal2Q9D3R6 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Katnal2Q9D3R6 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Katnal2Q9D3R6 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Katnal2Q9D3R6 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Katnal2Q9D3R6 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Katnal2Q9D3R6 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Katnal2Q9D3R6 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Katnal2Q9D3R6 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Katnal2Q9D3R6 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Katnal2Q9D3R6 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Katnal2Q9D3R6 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Katnal2Q9D3R6 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Katnal2Q9D3R6 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Katnal2Q9D3R6 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Katnal2Q9D3R6 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Katnal2Q9D3R6 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Katnal2Q9D3R6 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Katnal2Q9D3R6 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Katnal2Q9D3R6 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Katnal2Q9D3R6 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Katnal2Q9D3R6 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Katnal2Q9D3R6 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Katnal2Q9D3R6 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Katnal2Q9D3R6 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Katnal2Q9D3R6 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Katnal2Q9D3R6 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Katnal2Q9D3R6 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Katnal2Q9D3R6 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Katnal2Q9D3R6 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Katnal2Q9D3R6 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Katnal2Q9D3R6 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Katnal2Q9D3R6 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Katnal2Q9D3R6 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Katnal2Q9D3R6 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Katnal2Q9D3R6 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Katnal2Q9D3R6 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Katnal2Q9D3R6 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Katnal2Q9D3R6 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Katnal2Q9D3R6 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Katnal2Q9D3R6 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Katnal2Q9D3R6 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Katnal2Q9D3R6 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Katnal2Q9D3R6 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Katnal2Q9D3R6 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Katnal2Q9D3R6 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Katnal2Q9D3R6 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Katnal2Q9D3R6 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Katnal2Q9D3R6 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Katnal2Q9D3R6 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Katnal2Q9D3R6 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Katnal2Q9D3R6 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Katnal2Q9D3R6 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Katnal2Q9D3R6 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Katnal2Q9D3R6 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Katnal2Q9D3R6 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Katnal2Q9D3R6 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Katnal2Q9D3R6 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Katnal2Q9D3R6 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Katnal2Q9D3R6 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Katnal2Q9D3R6 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Katnal2Q9D3R6 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Katnal2Q9D3R6 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Katnal2Q9D3R6 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Katnal2Q9D3R6 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Katnal2Q9D3R6 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Katnal2Q9D3R6 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Katnal2Q9D3R6 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Katnal2Q9D3R6 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Katnal2Q9D3R6 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Katnal2Q9D3R6 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Katnal2Q9D3R6 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Katnal2Q9D3R6 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Katnal2Q9D3R6 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Katnal2Q9D3R6 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Katnal2Q9D3R6 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Katnal2Q9D3R6 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Katnal2Q9D3R6 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Katnal2Q9D3R6 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Katnal2Q9D3R6 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Katnal2Q9D3R6 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Katnal2Q9D3R6 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Katnal2Q9D3R6 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Katnal2Q9D3R6 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Katnal2Q9D3R6 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Katnal2Q9D3R6 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Katnal2Q9D3R6 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Katnal2Q9D3R6 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Katnal2Q9D3R6 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Katnal2Q9D3R6 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Katnal2Q9D3R6 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms