Protein–RNA interactions for Protein: Q9D300

Rasgef1c, Ras-GEF domain-containing family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1cQ9D300 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rasgef1cQ9D300 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rasgef1cQ9D300 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rasgef1cQ9D300 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rasgef1cQ9D300 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rasgef1cQ9D300 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rasgef1cQ9D300 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rasgef1cQ9D300 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rasgef1cQ9D300 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rasgef1cQ9D300 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rasgef1cQ9D300 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rasgef1cQ9D300 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rasgef1cQ9D300 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rasgef1cQ9D300 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rasgef1cQ9D300 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rasgef1cQ9D300 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rasgef1cQ9D300 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rasgef1cQ9D300 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rasgef1cQ9D300 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rasgef1cQ9D300 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rasgef1cQ9D300 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rasgef1cQ9D300 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rasgef1cQ9D300 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rasgef1cQ9D300 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rasgef1cQ9D300 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rasgef1cQ9D300 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rasgef1cQ9D300 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rasgef1cQ9D300 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rasgef1cQ9D300 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rasgef1cQ9D300 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rasgef1cQ9D300 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rasgef1cQ9D300 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rasgef1cQ9D300 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rasgef1cQ9D300 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rasgef1cQ9D300 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rasgef1cQ9D300 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rasgef1cQ9D300 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rasgef1cQ9D300 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rasgef1cQ9D300 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rasgef1cQ9D300 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rasgef1cQ9D300 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rasgef1cQ9D300 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rasgef1cQ9D300 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rasgef1cQ9D300 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rasgef1cQ9D300 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rasgef1cQ9D300 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rasgef1cQ9D300 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rasgef1cQ9D300 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rasgef1cQ9D300 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rasgef1cQ9D300 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rasgef1cQ9D300 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rasgef1cQ9D300 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rasgef1cQ9D300 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rasgef1cQ9D300 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rasgef1cQ9D300 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rasgef1cQ9D300 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rasgef1cQ9D300 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rasgef1cQ9D300 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rasgef1cQ9D300 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rasgef1cQ9D300 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rasgef1cQ9D300 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rasgef1cQ9D300 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rasgef1cQ9D300 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rasgef1cQ9D300 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rasgef1cQ9D300 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rasgef1cQ9D300 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rasgef1cQ9D300 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rasgef1cQ9D300 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rasgef1cQ9D300 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rasgef1cQ9D300 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rasgef1cQ9D300 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rasgef1cQ9D300 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rasgef1cQ9D300 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rasgef1cQ9D300 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rasgef1cQ9D300 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rasgef1cQ9D300 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rasgef1cQ9D300 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rasgef1cQ9D300 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rasgef1cQ9D300 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rasgef1cQ9D300 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rasgef1cQ9D300 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rasgef1cQ9D300 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rasgef1cQ9D300 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rasgef1cQ9D300 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rasgef1cQ9D300 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rasgef1cQ9D300 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rasgef1cQ9D300 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rasgef1cQ9D300 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rasgef1cQ9D300 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rasgef1cQ9D300 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rasgef1cQ9D300 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rasgef1cQ9D300 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rasgef1cQ9D300 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rasgef1cQ9D300 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rasgef1cQ9D300 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rasgef1cQ9D300 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rasgef1cQ9D300 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rasgef1cQ9D300 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rasgef1cQ9D300 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rasgef1cQ9D300 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms