Protein–RNA interactions for Protein: Q9D287

Bcas2, Pre-mRNA-splicing factor SPF27, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcas2Q9D287 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bcas2Q9D287 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bcas2Q9D287 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bcas2Q9D287 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bcas2Q9D287 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bcas2Q9D287 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bcas2Q9D287 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bcas2Q9D287 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bcas2Q9D287 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bcas2Q9D287 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bcas2Q9D287 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bcas2Q9D287 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bcas2Q9D287 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bcas2Q9D287 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bcas2Q9D287 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bcas2Q9D287 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bcas2Q9D287 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bcas2Q9D287 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bcas2Q9D287 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bcas2Q9D287 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bcas2Q9D287 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bcas2Q9D287 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bcas2Q9D287 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bcas2Q9D287 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bcas2Q9D287 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bcas2Q9D287 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bcas2Q9D287 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bcas2Q9D287 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bcas2Q9D287 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bcas2Q9D287 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Bcas2Q9D287 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Bcas2Q9D287 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bcas2Q9D287 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bcas2Q9D287 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bcas2Q9D287 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bcas2Q9D287 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bcas2Q9D287 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bcas2Q9D287 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bcas2Q9D287 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bcas2Q9D287 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bcas2Q9D287 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bcas2Q9D287 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bcas2Q9D287 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bcas2Q9D287 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Bcas2Q9D287 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bcas2Q9D287 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bcas2Q9D287 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bcas2Q9D287 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Bcas2Q9D287 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bcas2Q9D287 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bcas2Q9D287 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bcas2Q9D287 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bcas2Q9D287 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bcas2Q9D287 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bcas2Q9D287 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bcas2Q9D287 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bcas2Q9D287 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bcas2Q9D287 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bcas2Q9D287 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bcas2Q9D287 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bcas2Q9D287 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bcas2Q9D287 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Bcas2Q9D287 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bcas2Q9D287 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bcas2Q9D287 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bcas2Q9D287 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bcas2Q9D287 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bcas2Q9D287 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bcas2Q9D287 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bcas2Q9D287 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bcas2Q9D287 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bcas2Q9D287 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bcas2Q9D287 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bcas2Q9D287 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bcas2Q9D287 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bcas2Q9D287 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Bcas2Q9D287 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bcas2Q9D287 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bcas2Q9D287 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Bcas2Q9D287 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Bcas2Q9D287 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bcas2Q9D287 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bcas2Q9D287 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Bcas2Q9D287 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bcas2Q9D287 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bcas2Q9D287 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bcas2Q9D287 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bcas2Q9D287 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bcas2Q9D287 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bcas2Q9D287 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
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