Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1J3

Sarnp, SAP domain-containing ribonucleoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SarnpQ9D1J3 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SarnpQ9D1J3 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SarnpQ9D1J3 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SarnpQ9D1J3 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SarnpQ9D1J3 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SarnpQ9D1J3 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SarnpQ9D1J3 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SarnpQ9D1J3 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SarnpQ9D1J3 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SarnpQ9D1J3 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SarnpQ9D1J3 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SarnpQ9D1J3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SarnpQ9D1J3 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SarnpQ9D1J3 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SarnpQ9D1J3 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SarnpQ9D1J3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SarnpQ9D1J3 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SarnpQ9D1J3 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SarnpQ9D1J3 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SarnpQ9D1J3 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SarnpQ9D1J3 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SarnpQ9D1J3 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SarnpQ9D1J3 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SarnpQ9D1J3 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SarnpQ9D1J3 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SarnpQ9D1J3 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SarnpQ9D1J3 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SarnpQ9D1J3 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SarnpQ9D1J3 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SarnpQ9D1J3 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SarnpQ9D1J3 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SarnpQ9D1J3 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SarnpQ9D1J3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SarnpQ9D1J3 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SarnpQ9D1J3 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SarnpQ9D1J3 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SarnpQ9D1J3 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SarnpQ9D1J3 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SarnpQ9D1J3 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SarnpQ9D1J3 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SarnpQ9D1J3 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SarnpQ9D1J3 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SarnpQ9D1J3 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SarnpQ9D1J3 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SarnpQ9D1J3 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SarnpQ9D1J3 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SarnpQ9D1J3 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SarnpQ9D1J3 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SarnpQ9D1J3 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SarnpQ9D1J3 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SarnpQ9D1J3 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SarnpQ9D1J3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SarnpQ9D1J3 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SarnpQ9D1J3 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SarnpQ9D1J3 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SarnpQ9D1J3 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SarnpQ9D1J3 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SarnpQ9D1J3 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SarnpQ9D1J3 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SarnpQ9D1J3 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SarnpQ9D1J3 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SarnpQ9D1J3 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SarnpQ9D1J3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SarnpQ9D1J3 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SarnpQ9D1J3 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms