Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Mrpl28Q9D1B9 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms