Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtf2e1Q9D0D5 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtf2e1Q9D0D5 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtf2e1Q9D0D5 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtf2e1Q9D0D5 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtf2e1Q9D0D5 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtf2e1Q9D0D5 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtf2e1Q9D0D5 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtf2e1Q9D0D5 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtf2e1Q9D0D5 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtf2e1Q9D0D5 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtf2e1Q9D0D5 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtf2e1Q9D0D5 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtf2e1Q9D0D5 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtf2e1Q9D0D5 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gtf2e1Q9D0D5 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gtf2e1Q9D0D5 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gtf2e1Q9D0D5 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gtf2e1Q9D0D5 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gtf2e1Q9D0D5 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gtf2e1Q9D0D5 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gtf2e1Q9D0D5 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gtf2e1Q9D0D5 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gtf2e1Q9D0D5 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gtf2e1Q9D0D5 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gtf2e1Q9D0D5 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gtf2e1Q9D0D5 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gtf2e1Q9D0D5 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gtf2e1Q9D0D5 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gtf2e1Q9D0D5 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gtf2e1Q9D0D5 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gtf2e1Q9D0D5 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Gtf2e1Q9D0D5 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gtf2e1Q9D0D5 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Gtf2e1Q9D0D5 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gtf2e1Q9D0D5 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gtf2e1Q9D0D5 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gtf2e1Q9D0D5 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gtf2e1Q9D0D5 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gtf2e1Q9D0D5 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gtf2e1Q9D0D5 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gtf2e1Q9D0D5 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gtf2e1Q9D0D5 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gtf2e1Q9D0D5 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Gtf2e1Q9D0D5 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gtf2e1Q9D0D5 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gtf2e1Q9D0D5 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gtf2e1Q9D0D5 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gtf2e1Q9D0D5 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gtf2e1Q9D0D5 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gtf2e1Q9D0D5 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gtf2e1Q9D0D5 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gtf2e1Q9D0D5 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gtf2e1Q9D0D5 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gtf2e1Q9D0D5 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gtf2e1Q9D0D5 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gtf2e1Q9D0D5 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gtf2e1Q9D0D5 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gtf2e1Q9D0D5 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gtf2e1Q9D0D5 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gtf2e1Q9D0D5 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gtf2e1Q9D0D5 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gtf2e1Q9D0D5 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gtf2e1Q9D0D5 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gtf2e1Q9D0D5 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gtf2e1Q9D0D5 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gtf2e1Q9D0D5 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Gtf2e1Q9D0D5 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gtf2e1Q9D0D5 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gtf2e1Q9D0D5 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gtf2e1Q9D0D5 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gtf2e1Q9D0D5 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Gtf2e1Q9D0D5 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gtf2e1Q9D0D5 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gtf2e1Q9D0D5 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gtf2e1Q9D0D5 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gtf2e1Q9D0D5 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Gtf2e1Q9D0D5 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtf2e1Q9D0D5 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtf2e1Q9D0D5 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtf2e1Q9D0D5 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtf2e1Q9D0D5 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtf2e1Q9D0D5 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtf2e1Q9D0D5 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtf2e1Q9D0D5 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtf2e1Q9D0D5 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtf2e1Q9D0D5 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtf2e1Q9D0D5 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtf2e1Q9D0D5 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtf2e1Q9D0D5 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtf2e1Q9D0D5 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms