Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZA6

Nde1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nde1Q9CZA6 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms