Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ83

Mrpl55, 39S ribosomal protein L55, mitochondrial, mousemouse

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Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl55Q9CZ83 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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