Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY97

Ssu72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssu72Q9CY97 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms