Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW4

Rpl11, 60S ribosomal protein L11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl11Q9CXW4 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rpl11Q9CXW4 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rpl11Q9CXW4 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rpl11Q9CXW4 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rpl11Q9CXW4 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rpl11Q9CXW4 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rpl11Q9CXW4 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rpl11Q9CXW4 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rpl11Q9CXW4 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rpl11Q9CXW4 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rpl11Q9CXW4 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rpl11Q9CXW4 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rpl11Q9CXW4 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Rpl11Q9CXW4 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rpl11Q9CXW4 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rpl11Q9CXW4 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rpl11Q9CXW4 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rpl11Q9CXW4 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rpl11Q9CXW4 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rpl11Q9CXW4 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rpl11Q9CXW4 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Rpl11Q9CXW4 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rpl11Q9CXW4 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Rpl11Q9CXW4 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Rpl11Q9CXW4 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rpl11Q9CXW4 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rpl11Q9CXW4 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rpl11Q9CXW4 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rpl11Q9CXW4 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rpl11Q9CXW4 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rpl11Q9CXW4 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rpl11Q9CXW4 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rpl11Q9CXW4 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rpl11Q9CXW4 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms