Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Utp23Q9CX11 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Utp23Q9CX11 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Utp23Q9CX11 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Utp23Q9CX11 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Utp23Q9CX11 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Utp23Q9CX11 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Utp23Q9CX11 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Utp23Q9CX11 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Utp23Q9CX11 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Utp23Q9CX11 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Utp23Q9CX11 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Utp23Q9CX11 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Utp23Q9CX11 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Utp23Q9CX11 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Utp23Q9CX11 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Utp23Q9CX11 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Utp23Q9CX11 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Utp23Q9CX11 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Utp23Q9CX11 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Utp23Q9CX11 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Utp23Q9CX11 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Utp23Q9CX11 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Utp23Q9CX11 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Utp23Q9CX11 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Utp23Q9CX11 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Utp23Q9CX11 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Utp23Q9CX11 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Utp23Q9CX11 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Utp23Q9CX11 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Utp23Q9CX11 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Utp23Q9CX11 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Utp23Q9CX11 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Utp23Q9CX11 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Utp23Q9CX11 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Utp23Q9CX11 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Utp23Q9CX11 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Utp23Q9CX11 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Utp23Q9CX11 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Utp23Q9CX11 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Utp23Q9CX11 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Utp23Q9CX11 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Utp23Q9CX11 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Utp23Q9CX11 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Utp23Q9CX11 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Utp23Q9CX11 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Utp23Q9CX11 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Utp23Q9CX11 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Utp23Q9CX11 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Utp23Q9CX11 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Utp23Q9CX11 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Utp23Q9CX11 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Utp23Q9CX11 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Utp23Q9CX11 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Utp23Q9CX11 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Utp23Q9CX11 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Utp23Q9CX11 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Utp23Q9CX11 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Utp23Q9CX11 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Utp23Q9CX11 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Utp23Q9CX11 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Utp23Q9CX11 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Utp23Q9CX11 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Utp23Q9CX11 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Utp23Q9CX11 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Utp23Q9CX11 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Utp23Q9CX11 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Utp23Q9CX11 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Utp23Q9CX11 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Utp23Q9CX11 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Utp23Q9CX11 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Utp23Q9CX11 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Utp23Q9CX11 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Utp23Q9CX11 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Utp23Q9CX11 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Utp23Q9CX11 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Utp23Q9CX11 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Utp23Q9CX11 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Utp23Q9CX11 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Utp23Q9CX11 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Utp23Q9CX11 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Utp23Q9CX11 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Utp23Q9CX11 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Utp23Q9CX11 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Utp23Q9CX11 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Utp23Q9CX11 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Utp23Q9CX11 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Utp23Q9CX11 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Utp23Q9CX11 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Utp23Q9CX11 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Utp23Q9CX11 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Utp23Q9CX11 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Utp23Q9CX11 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Utp23Q9CX11 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Utp23Q9CX11 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Utp23Q9CX11 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Utp23Q9CX11 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Utp23Q9CX11 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Utp23Q9CX11 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Utp23Q9CX11 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
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