Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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