Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cxxc1Q9CWW7 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cxxc1Q9CWW7 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cxxc1Q9CWW7 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cxxc1Q9CWW7 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cxxc1Q9CWW7 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cxxc1Q9CWW7 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxxc1Q9CWW7 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxxc1Q9CWW7 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxxc1Q9CWW7 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxxc1Q9CWW7 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxxc1Q9CWW7 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxxc1Q9CWW7 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxxc1Q9CWW7 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxxc1Q9CWW7 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxxc1Q9CWW7 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxxc1Q9CWW7 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxxc1Q9CWW7 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxxc1Q9CWW7 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxxc1Q9CWW7 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxxc1Q9CWW7 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxxc1Q9CWW7 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxxc1Q9CWW7 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxxc1Q9CWW7 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxxc1Q9CWW7 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxxc1Q9CWW7 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxxc1Q9CWW7 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxxc1Q9CWW7 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxxc1Q9CWW7 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxxc1Q9CWW7 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxxc1Q9CWW7 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxxc1Q9CWW7 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxxc1Q9CWW7 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxxc1Q9CWW7 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxxc1Q9CWW7 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxxc1Q9CWW7 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxxc1Q9CWW7 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxxc1Q9CWW7 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxxc1Q9CWW7 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxxc1Q9CWW7 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxxc1Q9CWW7 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxxc1Q9CWW7 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxxc1Q9CWW7 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxxc1Q9CWW7 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxxc1Q9CWW7 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms