Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU4

UPF0690 protein C1orf52 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CWU4 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9CWU4 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CWU4 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9CWU4 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9CWU4 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9CWU4 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9CWU4 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9CWU4 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9CWU4 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9CWU4 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9CWU4 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9CWU4 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9CWU4 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9CWU4 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9CWU4 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9CWU4 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CWU4 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CWU4 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CWU4 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CWU4 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CWU4 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CWU4 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CWU4 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CWU4 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CWU4 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CWU4 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CWU4 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CWU4 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CWU4 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CWU4 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CWU4 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CWU4 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CWU4 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
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