Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Ddx28Q9CWT6 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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