Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWI3

Bccip, BRCA2 and CDKN1A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BccipQ9CWI3 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BccipQ9CWI3 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BccipQ9CWI3 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BccipQ9CWI3 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BccipQ9CWI3 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BccipQ9CWI3 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BccipQ9CWI3 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BccipQ9CWI3 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BccipQ9CWI3 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BccipQ9CWI3 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BccipQ9CWI3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BccipQ9CWI3 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BccipQ9CWI3 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BccipQ9CWI3 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BccipQ9CWI3 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BccipQ9CWI3 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BccipQ9CWI3 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BccipQ9CWI3 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BccipQ9CWI3 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BccipQ9CWI3 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BccipQ9CWI3 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BccipQ9CWI3 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BccipQ9CWI3 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BccipQ9CWI3 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BccipQ9CWI3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BccipQ9CWI3 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BccipQ9CWI3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BccipQ9CWI3 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BccipQ9CWI3 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BccipQ9CWI3 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BccipQ9CWI3 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BccipQ9CWI3 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BccipQ9CWI3 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BccipQ9CWI3 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
BccipQ9CWI3 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
BccipQ9CWI3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BccipQ9CWI3 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BccipQ9CWI3 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BccipQ9CWI3 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BccipQ9CWI3 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BccipQ9CWI3 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BccipQ9CWI3 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BccipQ9CWI3 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BccipQ9CWI3 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BccipQ9CWI3 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BccipQ9CWI3 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BccipQ9CWI3 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BccipQ9CWI3 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BccipQ9CWI3 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BccipQ9CWI3 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BccipQ9CWI3 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BccipQ9CWI3 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BccipQ9CWI3 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BccipQ9CWI3 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BccipQ9CWI3 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BccipQ9CWI3 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BccipQ9CWI3 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BccipQ9CWI3 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BccipQ9CWI3 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BccipQ9CWI3 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BccipQ9CWI3 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BccipQ9CWI3 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
BccipQ9CWI3 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BccipQ9CWI3 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BccipQ9CWI3 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
BccipQ9CWI3 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BccipQ9CWI3 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BccipQ9CWI3 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BccipQ9CWI3 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BccipQ9CWI3 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BccipQ9CWI3 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BccipQ9CWI3 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BccipQ9CWI3 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BccipQ9CWI3 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BccipQ9CWI3 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
BccipQ9CWI3 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BccipQ9CWI3 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BccipQ9CWI3 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BccipQ9CWI3 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BccipQ9CWI3 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BccipQ9CWI3 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BccipQ9CWI3 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BccipQ9CWI3 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BccipQ9CWI3 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BccipQ9CWI3 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BccipQ9CWI3 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BccipQ9CWI3 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BccipQ9CWI3 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BccipQ9CWI3 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BccipQ9CWI3 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BccipQ9CWI3 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BccipQ9CWI3 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BccipQ9CWI3 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BccipQ9CWI3 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
BccipQ9CWI3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BccipQ9CWI3 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BccipQ9CWI3 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BccipQ9CWI3 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BccipQ9CWI3 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BccipQ9CWI3 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms