Protein–RNA interactions for Protein: Q9CV28

MINDY3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-3, mousemouse

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY3Q9CV28 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms