Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUU3

Sycp2, Synaptonemal complex protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2Q9CUU3 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Sycp2Q9CUU3 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Sycp2Q9CUU3 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Sycp2Q9CUU3 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sycp2Q9CUU3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sycp2Q9CUU3 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sycp2Q9CUU3 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sycp2Q9CUU3 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sycp2Q9CUU3 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Sycp2Q9CUU3 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sycp2Q9CUU3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sycp2Q9CUU3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sycp2Q9CUU3 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sycp2Q9CUU3 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Sycp2Q9CUU3 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Sycp2Q9CUU3 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Sycp2Q9CUU3 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Sycp2Q9CUU3 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Sycp2Q9CUU3 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Sycp2Q9CUU3 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Sycp2Q9CUU3 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Sycp2Q9CUU3 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Sycp2Q9CUU3 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Sycp2Q9CUU3 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Sycp2Q9CUU3 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Sycp2Q9CUU3 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Sycp2Q9CUU3 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Sycp2Q9CUU3 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Sycp2Q9CUU3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Sycp2Q9CUU3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Sycp2Q9CUU3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Sycp2Q9CUU3 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Sycp2Q9CUU3 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Sycp2Q9CUU3 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Sycp2Q9CUU3 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Sycp2Q9CUU3 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Sycp2Q9CUU3 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Sycp2Q9CUU3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Sycp2Q9CUU3 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Sycp2Q9CUU3 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Sycp2Q9CUU3 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Sycp2Q9CUU3 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Sycp2Q9CUU3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Sycp2Q9CUU3 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Sycp2Q9CUU3 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Sycp2Q9CUU3 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Sycp2Q9CUU3 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Sycp2Q9CUU3 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Sycp2Q9CUU3 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Sycp2Q9CUU3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Sycp2Q9CUU3 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Sycp2Q9CUU3 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Sycp2Q9CUU3 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Sycp2Q9CUU3 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Sycp2Q9CUU3 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Sycp2Q9CUU3 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Sycp2Q9CUU3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Sycp2Q9CUU3 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Sycp2Q9CUU3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Sycp2Q9CUU3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Sycp2Q9CUU3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Sycp2Q9CUU3 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Sycp2Q9CUU3 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Sycp2Q9CUU3 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Sycp2Q9CUU3 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Sycp2Q9CUU3 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Sycp2Q9CUU3 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Sycp2Q9CUU3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Sycp2Q9CUU3 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Sycp2Q9CUU3 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Sycp2Q9CUU3 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Sycp2Q9CUU3 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC28.08■■■□□ 2.08
Sycp2Q9CUU3 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Sycp2Q9CUU3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Sycp2Q9CUU3 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Sycp2Q9CUU3 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Sycp2Q9CUU3 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Sycp2Q9CUU3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Sycp2Q9CUU3 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Sycp2Q9CUU3 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Sycp2Q9CUU3 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Sycp2Q9CUU3 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Sycp2Q9CUU3 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Sycp2Q9CUU3 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Sycp2Q9CUU3 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Sycp2Q9CUU3 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Sycp2Q9CUU3 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Sycp2Q9CUU3 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Sycp2Q9CUU3 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Sycp2Q9CUU3 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Sycp2Q9CUU3 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Sycp2Q9CUU3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Sycp2Q9CUU3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Sycp2Q9CUU3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Sycp2Q9CUU3 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Sycp2Q9CUU3 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Sycp2Q9CUU3 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Sycp2Q9CUU3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Sycp2Q9CUU3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Sycp2Q9CUU3 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms